Genética y Genómica

El Centro de Genética y Genómica cuenta con dos equipos de electroforesis capilar ABI310 (AppliedBiosystems), un equipo MiSeq (Illumina), un equipo de microarray (Affymetrix) y un equipo de qPCR Stratagene 3005 (Agilent). Con este equipamiento, estamos capacitados para realizar diagnóstico clínico y estudios de investigación a través de las siguientes técnicas:

  • Análisis de Fragmentos (PCR fluorescente, TP-PCR, MLPA, SSP)
  • Secuenciación de Sanger (fragmentos hasta 800 pb)
  • Secuenciación masiva de paneles o genomas pequeños ( máx salida ~10 Gb)
  • Perfiles de expresión (GeneChip Human Transcriptome Array)
  • Estudio de asociación del genoma completo – GWAS (Genome-Wide Human SNP Array 6.0)
  • Cariotipo molecular (Array CGH – CytoScan HD, CytoScan Optima)
  • Detección y/o cuantificación por qPCR

Bioinformática

Sabio UDD

El Centro de Genética y Genómica hospeda al Servicio de Análisis Bioinformático de la UDD (SABio – UDD). Contamos con un servidor tipo torre y una clúster para computación de alto rendimiento (FONDEQUIP EQM150093).

Estamos encargados de gestionar el análisis de datos generados en el CGG y otros centros y realizamos protocolos estándares para:

  • Control de calidad de data genómica
  • Identificación de variantes genéticas
  • Anotación de patogenicidad de variantes
  • Determinación de ancestría global y local

Y muchos más, dependiendo de las características y preguntas biológicas asociadas.

Más información.

Biología Molecular

  • Cultivo primario y de líneas celulares
  • Análisis de expresión génica (tiempo real, arrays de expresión) en tumores, líneas celulares y material fijado y conservado en parafina (FFPE)
  • Análisis de biomarcadores tumorales por inmunohistoquímica
  • Western Blot
  • Modulación de expresión génica por RNA de interferencia e inhibidores de metilación
  • Clonación y transfección de genes de interés
  • Ensayos de proliferación y citotoxicidad

 

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