{"id":9706,"date":"2021-07-12T13:03:59","date_gmt":"2021-07-12T17:03:59","guid":{"rendered":"https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/?p=9706"},"modified":"2021-07-12T14:12:07","modified_gmt":"2021-07-12T18:12:07","slug":"universidades-inician-plan-de-aceleracion-para-secuenciar-el-sars-cov-2-y-detectar-variantes-del-virus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/2021\/07\/12\/universidades-inician-plan-de-aceleracion-para-secuenciar-el-sars-cov-2-y-detectar-variantes-del-virus\/","title":{"rendered":"Universidades inician plan de aceleraci\u00f3n para secuenciar el SARS-CoV-2 y detectar variantes del virus"},"content":{"rendered":"\n<p class=\"has-text-align-center\"><strong>A trav\u00e9s de la red cient\u00edfica impulsada por el Ministerio de Ciencia, laboratorios universitarios pusieron en marcha esta semana el trabajo para la detecci\u00f3n y an\u00e1lisis de las variantes, fortaleciendo e incrementando la capacidad de vigilancia gen\u00f3mica actual del pa\u00eds. Gracias al aporte de la minera Anglo American, se adquirieron los reactivos necesarios para la secuenciaci\u00f3n del Coronavirus y para procesar las primeras muestras como complemento al trabajo del ISP.<\/strong><\/p>\n\n\n<div id=\"gallery-1\" class=\"carousel slide carousel-gallery\" data-ride=\"false\" data-interval=\"false\"><div class=\"carousel-inner\" role=\"listbox\"><figure class=\"carousel-item active\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"952\" height=\"534\" src=\"https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/files\/2021\/07\/Inicio-plan-de-aceleraci\u00f3n-secuenciaci\u00f3n-SARS-CoV-2-7-680x382.jpeg\" class=\"attachment-landscape_952 size-landscape_952 lazyload\" alt=\"\" sizes=\"auto, (max-width: 952px) 100vw, 952px\" data-src=\"https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/files\/2021\/07\/Inicio-plan-de-aceleraci\u00f3n-secuenciaci\u00f3n-SARS-CoV-2-7-952x534.jpeg\" 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class=\"carousel-counter\"><span class=\"carousel-counter-current\"><\/span> \/ <span class=\"carousel-counter-total\"><\/span><\/div><a class=\"carousel-control-prev\" href=\"#gallery-1\" role=\"button\" data-slide=\"prev\"><svg aria-hidden=\"true\" class=\"svg-chevron-left-dims\"><use xlink:href='https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/wp-content\/themes\/facultades-2018\/assets\/img\/svg\/dist\/main.svg?version=1695853099#chevron-left'><\/use><\/svg><span class=\"sr-only\">Anterior<\/span><\/a><a class=\"carousel-control-next\" href=\"#gallery-1\" role=\"button\" data-slide=\"next\"><svg aria-hidden=\"true\" class=\"svg-chevron-right-dims\"><use xlink:href='https:\/\/medicina.udd.cl\/icim\/wp-content\/themes\/facultades-2018\/assets\/img\/svg\/dist\/main.svg?version=1695853099#chevron-right'><\/use><\/svg><span class=\"sr-only\">Siguiente<\/span><\/a><\/footer><\/div>\n\n\n<p>Frente a la preocupaci\u00f3n por la diseminaci\u00f3n de variantes del SARS-CoV-2 -como la variante Delta detectada por primera vez en India, presente en m\u00e1s de 90 pa\u00edses y, seg\u00fan los expertos, m\u00e1s transmisible- las autoridades han buscado fortalecer la vigilancia gen\u00f3mica del virus, con el fin de aumentar la pesquisa y an\u00e1lisis tanto de variantes existentes como de nuevas que puedan surgir.<\/p>\n\n\n\n<p>En este\ncontexto, el Ministerio de Ciencia, Tecnolog\u00eda, Conocimiento e Innovaci\u00f3n,\narticul\u00f3 una red de universidades desde Antofagasta a Punta Arenas, cuyo\nobjetivo es aumentar la capacidad nacional para secuenciar el SARS-CoV-2.\nActualmente, este trabajo es realizado por el Instituto de Salud P\u00fablica (ISP)\nque procesa cerca de 200 muestras semanales, cifra que podr\u00eda llegar a\nduplicarse con la colaboraci\u00f3n de estos laboratorios de distintas regiones del\npa\u00eds.&nbsp; <\/p>\n\n\n\n<p>El trabajo del\nprimer grupo de 6 universidades con capacidad inmediata para secuenciar se ver\u00e1\nfortalecido con el aporte de las mineras que permitieron la adquisici\u00f3n de\ninsumos y reactivos necesarios para realizar el an\u00e1lisis de muestras.<\/p>\n\n\n\n<p>Una de las\niniciativas es liderada por la Universidad del Desarrollo (UDD) junto a la\nUniversidad Andr\u00e9s Bello (UNAB) y la Universidad Austral, quienes recibieron\naportes de Anglo American para la compra de los insumos. El aporte de la\nempresa minera consisti\u00f3 en la entrega de <em>kits<\/em>\npara secuenciar (a trav\u00e9s de la tecnolog\u00eda Illumina) que permite procesar entre\n3 mil y 4 mil muestras, las que ser\u00e1n divididas equitativamente entre las tres\nuniversidades. <\/p>\n\n\n\n<p>Gracias a esta\ncolaboraci\u00f3n, los equipos cient\u00edficos ya comenzaron a montar las t\u00e9cnicas de\nsecuenciaci\u00f3n y enviar\u00e1n muestras preliminares al ISP para su validaci\u00f3n.\nDurante los pr\u00f3ximos d\u00edas, las instituciones estar\u00e1n en condiciones de comenzar\na analizar secuencias del Coronavirus de acuerdo a los criterios y protocolos\nque define el Ministerio de Salud. <\/p>\n\n\n\n<p>El ministro de\nCiencia, Andr\u00e9s Couve, valor\u00f3 el avance y el compromiso de las instituciones\nacad\u00e9micas y privadas que han aportado a este plan de aceleraci\u00f3n para la\nsecuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica: \u201cUna vez m\u00e1s las universidades ponen a disposici\u00f3n del\npa\u00eds su talento y capacidades para enfrentar la pandemia. Esta red articulada\ndesde el Ministerio de Ciencia, que cuenta con el compromiso de equipos cient\u00edficos\ny apoyo del sector privado con USD$500 mil, nos permite acelerar y complementar\nel trabajo del ISP, potenciando el seguimiento de variantes y desconcentrando\nel an\u00e1lisis en distintas regiones del pa\u00eds\u201d. <\/p>\n\n\n\n<p>Seg\u00fan explic\u00f3 Gonzalo Encina, investigador del Instituto de Ciencias e Innovaci\u00f3n en Medicina (ICIM) de la UDD, a cargo de estas gestiones, el proceso comienza con la recepci\u00f3n de muestras de casos positivos de COVID-19. Posteriormente, se realiza la extracci\u00f3n del ARN del virus y se comienza con la preparaci\u00f3n de lo que se conoce como \u2018librer\u00edas de secuenciaci\u00f3n\u2019. \u201cEste es un proceso cr\u00edtico para el \u00e9xito de la secuenciaci\u00f3n y requiere de insumos espec\u00edficos que permiten convertir el ARN del virus a ADN y agregarle marcas espec\u00edficas al ADN viral de cada paciente para diferenciar las secuencias de cada virus, ya que los instrumentos de secuenciaci\u00f3n permiten procesar 48 muestras simult\u00e1neamente. Con 48 muestras se asegura la buena calidad de las secuencias\u201d, dijo. <\/p>\n\n\n\n<p>En este sentido,\na\u00f1adi\u00f3 que \u201clas PCR nos dicen si hay virus o no. Lo que hacemos con la\nsecuenciaci\u00f3n es <em>\u2018un zoom\u2019<\/em> a la muestra y leer cada letra del genoma\nviral, lo que permite identificar todas las variantes, las ya conocidas y\ntambi\u00e9n cualquier otra variante nueva que pueda aparecer\u201d.<\/p>\n\n\n\n<p>En una primera\netapa preliminar, las secuencias de 10 muestras virales se enviar\u00e1n al ISP para\nsu validaci\u00f3n, quien certifica la buena calidad de la t\u00e9cnica empleada y\npermitir\u00eda a las instituciones comenzar a secuenciar de manera sostenida y\nsistem\u00e1tica.<\/p>\n\n\n\n<p>Para Encina, es\nfundamental contar con la tecnolog\u00eda para la secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica del\nCoronavirus, \u201cpues esto no s\u00f3lo permite detectar variantes que est\u00e9n circulando\no hayan ingresado a nuestro pa\u00eds, sino que tambi\u00e9n descubrir nuevas variantes\nque puedan ir surgiendo\u201d, asegur\u00f3.<\/p>\n\n\n\n<p>En esta misma\nl\u00ednea opin\u00f3 Jos\u00e9 Ignacio M\u00e9ndez, gerente de Salud de Anglo American: \u201cPara\nnosotros, participar en este proyecto a trav\u00e9s de la donaci\u00f3n de kits de\nsecuenciaci\u00f3n a estas tres universidades, constituye una oportunidad para apoyar\nal Ministerio de Salud a mejorar la capacidad de secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica en\nnuestro pa\u00eds y, de esta manera, establecer un sistema de vigilancia robusto y\ndescentralizado. Por otra parte, nos permite colaborar con la academia y\naportar al desarrollo del conocimiento. En la medida que m\u00e1s se realice\nsecuenciaci\u00f3n en nuestro pa\u00eds, mejor entenderemos el comportamiento de la\npandemia, conoceremos las cepas m\u00e1s relevantes y podremos prepararnos\nadecuadamente para responder a esta emergencia de salud p\u00fablica\u201d.<\/p>\n\n\n\n<p>En tanto,&nbsp; Cecilia Vial, investigadora UDD y parte del\nequipo encargado de realizar secuenciaci\u00f3n en los laboratorios del ICIM, se\nrefiri\u00f3 a la importancia de la relaci\u00f3n entre las empresas y las universidades,\npues \u201csi bien contamos con la expertise y el equipamiento, se trata de insumos\ny tecnolog\u00edas complejas y caras, por lo que este aporte privado es un\nacelerador para poder entrenar al personal y poner a punto la t\u00e9cnica, de\nmanera de poder certificarse ante el ISP y estar listos para entregar resultados\nde calidad apenas se firmen los convenios para participar de la Red de\nVigilancia Gen\u00f3mica impulsada por el MINSAL que dar\u00e1 continuidad a la\niniciativa\u201d. <\/p>\n\n\n\n<p>Agreg\u00f3 que, \u201cde\nesta forma, el aporte de estas empresas va a aumentar r\u00e1pidamente la capacidad\nde secuenciaci\u00f3n, permitiendo tener m\u00e1s informaci\u00f3n de los coronavirus\ncirculantes en el pa\u00eds, lo cual es important\u00edsimo en este punto de la pandemia\nen que vemos el surgimiento de nuevas variantes\u201d. <strong><\/strong><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>A trav\u00e9s de la red cient\u00edfica impulsada por el Ministerio de Ciencia, laboratorios universitarios pusieron en marcha esta semana el trabajo para la detecci\u00f3n y an\u00e1lisis de las variantes, fortaleciendo e incrementando la capacidad de vigilancia gen\u00f3mica actual del pa\u00eds. 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